真核生物多基因预测结果整合算法

• 作者: 刘金定 朱毅华 黄水清
• 来源期刊: 数据采集与处理
• 学科: 工学
• 关键词: 多基因整合 一致基因 基因预测 动态规划
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 页码范围: 679-684
• 页数: 6页
• 分类号: TN713|Q751
• 字数: 5103字
• 语种: 中文

摘要

针对独立基因预测算法可靠性较差的缺点,提出了真核生物多基因预测结果整合算法(Algorithm for integration of multiple eukaryotie gene prediction results,AIMEGPR).该算法在综合分析各种预测算法结果的基础上,首先用极大似然法估计各种预测算法的性能参数,然后利用这些性能参数计算基因证据区间上各个基因片段归属于各种基因元件类型的后验概率,最后采用动态规划法在基因证据区间上确定最优的一致基因结构.AIMEGPR既不需要人工定制整合规则,也不需要复杂的训练学习,因此AIMEGPR尤其在基因组新测序物种上进行编码基因注释时具有十分显著的优越性.实验结果表明,利用AIMEGPR算法对多基因预测结果整合可以明显提高一致基因的可靠性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄水清	南京农业大学信息科学技术学院	94	1041	17.0	27.0
2	刘金定	南京农业大学信息科学技术学院	15	77	4.0	8.0
3	朱毅华	南京农业大学信息科学技术学院	26	506	8.0	22.0