两株登革2型病毒E、NS1蛋白基因序列测定及其系统发生分析

• 作者: 左丽 李永念 舒莉萍 郝牧
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 登革病毒 E基因 NS1基因 系统发生树
• 年，卷（期）: 2004,（4）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 287-291
• 页数: 5页
• 分类号: R373
• 字数: 4662字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2004.04.012

摘要

目的对从登革出血热(dengue hemorrhagic fever, DHF)病人血清分离到的一株登革2型病毒(dengue virus type 2, DEN-2 B株)和DEN-2 NGC株作E、NS1蛋白部分基因序列测定并进行系统发生树分析,了解其变异及分子进化特征.方法利用RT-PCR法扩增B株和NGC株E、NS1部分基因片段,PCR产物直接测序;利用DNAssist软件预测其氨基酸序列,以及PHYLIP软件的CLUSTAL方法绘制系统发生树.结果 B株与NGC株E蛋白基因区第1～476nt(476bp)碱基序列存在8个位点的差异;编码氨基酸存在4个位置的不同;NS1基因区第589～1002nt (413bp) 碱基序列存在7个位点的差异,编码氨基酸有2个位置的改变;B株与NGC株和DEN-2 44株E区部分片段核苷酸同源性分别为99.1%和98.7%;与NS1区部分片段核苷酸同源性分别为98.3%和98.1%.B株E基因、NS1基因序列已登录GenBank,注册号分别为AY179733和AY238471.结论 B株E、NS1基因序列和氨基酸序列与NGC株存在差异;B株与我国海南1989年流行的DEN-2 44株和NGC株系统进化关系较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	左丽	贵阳医学院免疫学教研室	98	378	9.0	15.0
2	舒莉萍	贵阳医学院免疫学教研室	37	117	6.0	8.0
3	李永念	贵阳医学院免疫学教研室	30	138	7.0	10.0
4	郝牧	贵阳医学院免疫学教研室	10	33	3.0	5.0