大豆NBS类抗病相关基因的克隆与序列分析

• 作者: 李文滨 杨庆凯 杨秀红 陈庆山
• 来源期刊: 高技术通讯
• 关键词: 大豆 NBS类抗病相关基因 克隆 内含子
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 71-78
• 页数: 8页
• 字数: 5162字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1002-0470.2005.02.016

摘要

根据拟南芥RPS2基因、烟草N基因和亚麻L6基因的保守结构域设计简并引物,采用RT-PCR方法从大豆抗疫霉根腐病品种绥农10号的RNA中扩增获得两个通读的大豆NBS类抗病基因同源片段RNEAU-1和RNEAU-2,长度均为513bp,编码171个氨基酸.以RNEAU-1为靶序列,采用RACE方法获得了全长3574bp的大豆抗病相关基因SR1,该基因包括3411bp的开放读码框,72bp的5′非翻译区(non-translated region,NTR),68bp的3′非翻译区和20bp的多聚腺苷酸尾.编码1137个通读的蛋白质氨基酸序列,基因编码产物具有TIR、NBS、LRR、HD(conserved domain 1)和conserved domain 2等一系列抗病基因的保守结构域.同源性比较和序列分析显示,该基因为大豆中TIR-NBS-LRR类抗病相关基因.Southern杂交结果表明,SR1基因(或其同源基因)在大豆中具有2～4个拷贝.RT-PCR检测表明,SR1基因在大豆中为低丰度组成型表达,其表达不受病原菌接种和水杨酸的诱导,亦无组织特异性.以绥农10号基因组DNA为模板扩增得到长度为3972bp的SR1基因转录区核苷酸序列,其结构包含5个外显子和4个内含子.SR1基因在GenBank上的登录号为AY193892.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨庆凯	东北农业大学大豆研究所	81	1964	26.0	40.0
2	陈庆山	东北农业大学大豆研究所	101	1391	21.0	33.0
3	李文滨	东北农业大学大豆研究所	153	1793	22.0	33.0
4	杨秀红	东北农业大学大豆研究所	8	281	7.0	8.0