广州管圆线虫幼虫cDNA文库的构建及其表达模式与成虫表达模式的EST分析

• 作者: 彭鸿娟 李华 沈浩贤 赵醒村 陈晓光
• 来源期刊: 寄生虫与医学昆虫学报
• 学科: 医学
• 关键词: 广州管圆线虫 幼虫 cDNA文库 表达模式
• 年，卷（期）: 2005,（2）
• 所属期刊栏目: 著述
• 页码范围: 82-89
• 页数: 8页
• 分类号: R3
• 字数: 2759字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-0507.2005.02.004

摘要

从感染广州管圆线虫3周的大鼠脑部挑取幼虫,提取其总RNA,运用"SMART cDNA文库构建试剂盒"构建其cDNA文库.分别将成虫和幼虫cDNA文库中的噬菌体克隆转化成噬菌粒,用5'端测序引物进行测序.利用BLAST程序对获取的EST从核苷酸和氨基酸水平进行同源性搜索.结果显示:所建文库的初始滴度为2.19 × 106pfu/mL,经1次扩增后的滴度为1.0×1010pfu/mL,插入子的平均长度为1.2kb,重组率为97.3%.从成虫的cDNA文库中得到64个EST,其中有意义的EST有54个,占82.8%;无意义的EST有10个,占17.2%.64个成虫EST序列中,rRNA基因49个,占总EST数的76.6%.从幼虫的cDNA文库中共得到106个EST,其中有意义的EST有91个,占85.8%;无意义的EST有15个,占14.2%.106个幼虫EST序列中rRNA基因78个,占总EST数的73.6%.本研究首次成功构建了广州管圆线虫幼虫的cDNA文库,EST分析显示广州管圆线虫幼虫和成虫基因表达谱中rRNA基因均占大多数.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭鸿娟	南方医科大学病原生物学教研室	27	202	9.0	13.0
2	李华	南方医科大学病原生物学教研室	65	491	13.0	18.0
3	陈晓光	南方医科大学病原生物学教研室	92	699	14.0	19.0
4	沈浩贤	广州医学院病原生物学教研室	42	269	10.0	14.0
5	赵醒村	南方医科大学病原生物学教研室	65	227	8.0	12.0