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改进的拟南芥CAPS标记方法
改进的拟南芥CAPS标记方法
作者:
苑克俊
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
植物
拟南芥
基因组
CAPS(切割扩增多态性序列)
分子标记
限制性内切酶
摘要:
在模式植物拟南芥(Arabidopsisthaliana)的一种生态型Columbia(Col)中,存在大多数CAPS(切割扩增的多态性序列)标记的标记酶识别位点;而用于分析的酶中,只有37.5%~47.5%的酶在Col基因组的扩增区段存在酶识别位点,超过半数的酶在大多数CAPS标记的开发中无作用.因此,建立了一种改进的开发CAPS标记的方法.首先进行限制性内切酶分析,筛选出在Col基因组的扩增区段存在酶识别位点的候选酶,然后再在候选酶中筛选CAPS标记酶;只有在候选酶中找不到CAPS标记酶时,才在其它酶中筛选.应用实验结果表明,即使不知道拟南芥的另两种生态型Landsberg erecta(Ler)和Cape VerdeIs-lands(Cvi)的基因组序列,也可利用Col基因组序列开发Ler和Cvi的CAPS标记,可节约超过50%酶的费用.这种基于基因组的CAPS(geCAPS)方法在其它植物如水稻(Oryza sativa)和茶叶(Camellia sinensis)中的应用进行了讨论.
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重测序数据
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篇名
改进的拟南芥CAPS标记方法
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
植物
拟南芥
基因组
CAPS(切割扩增多态性序列)
分子标记
限制性内切酶
年,卷(期)
2005,(5)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
580-586
页数
7页
分类号
S4
字数
6460字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2005.05.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
苑克俊
60
475
10.0
19.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
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8
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