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摘要:
在模式植物拟南芥(Arabidopsisthaliana)的一种生态型Columbia(Col)中,存在大多数CAPS(切割扩增的多态性序列)标记的标记酶识别位点;而用于分析的酶中,只有37.5%~47.5%的酶在Col基因组的扩增区段存在酶识别位点,超过半数的酶在大多数CAPS标记的开发中无作用.因此,建立了一种改进的开发CAPS标记的方法.首先进行限制性内切酶分析,筛选出在Col基因组的扩增区段存在酶识别位点的候选酶,然后再在候选酶中筛选CAPS标记酶;只有在候选酶中找不到CAPS标记酶时,才在其它酶中筛选.应用实验结果表明,即使不知道拟南芥的另两种生态型Landsberg erecta(Ler)和Cape VerdeIs-lands(Cvi)的基因组序列,也可利用Col基因组序列开发Ler和Cvi的CAPS标记,可节约超过50%酶的费用.这种基于基因组的CAPS(geCAPS)方法在其它植物如水稻(Oryza sativa)和茶叶(Camellia sinensis)中的应用进行了讨论.
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文献信息
篇名 改进的拟南芥CAPS标记方法
来源期刊 农业生物技术学报 学科 农学
关键词 植物 拟南芥 基因组 CAPS(切割扩增多态性序列) 分子标记 限制性内切酶
年,卷(期) 2005,(5) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 580-586
页数 7页 分类号 S4
字数 6460字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-7968.2005.05.008
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作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 苑克俊 60 475 10.0 19.0
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植物
拟南芥
基因组
CAPS(切割扩增多态性序列)
分子标记
限制性内切酶
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农业生物技术学报
月刊
1674-7968
11-3342/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
2-367
1993
chi
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