斜带石斑鱼神经坏死病毒基因组RNA1和RNA2序列测定及分析

• 作者: 何建国 吕玲 殷志新 翁少萍 陈晓艳 黄剑南
• 来源期刊: 中山大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 斜带石斑鱼 Epinephelus coioides神经坏死病毒 基因组序列测定与分析 β诺达病毒
• 年，卷（期）: 2005,（1）
• 页码范围: 73-77
• 页数: 5页
• 分类号: S941.41
• 字数: 3526字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0529-6579.2005.01.019

摘要

根据GenBank数据库公布的鱼类神经坏死病毒(nervous necrosis virus,NNV)同源序列设计了7对特异性引物,采用RT-PCR方法扩增出目的片断,将PCR产物测序和分析.斜带石斑鱼Epinephelus coioides神经坏死病毒(orange-spotted NNV,OGNNV)基因组由两个片断(RNA1和RNA2)组成,RNA1由3 103个核苷酸组成,含有一个开放阅读框,编码982个氨基酸;RNA2由1 433个核苷酸组成,含有一个开放阅读框,编码338个氨基酸.OGNNV基因组与新加坡GGNNV(greasy grouper NNV)的基因组有高度的相似性.分析病毒的RNA2序列发现:OGNNV与DGNNV(dragon grouper NNV)、RGNNV(redspotted NNV)和GGNNV的亲缘关系很近,并且具有相同的中和位点;分析病毒的RNA1序列,发现在OGNNV的RNA1序列中同样可以找到依赖RNA的RNA聚合酶的6个模序(motif).根据同源性比较和系统进化分析,OGNNV属于RGNNV血清型的成员.