Alzheimer's疾病相关蛋白质相互作用网络构建及其相互作用预测

• 作者: 杨洁 王炜 蒋雄飞
• 来源期刊: 南京大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 阿尔茨海默氏病 蛋白质相互作用 复杂网络 无标度网络 相互作用预测 序列模体
• 年，卷（期）: 2006,（5）
• 页码范围: 479-489
• 页数: 11页
• 分类号: R5
• 字数: 5310字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0469-5097.2006.05.006

摘要

依据无标度网络的相关理论,提出一种预测蛋白质-蛋白质相互作用的算法,并预测潜在的作用位点.收集了所有与阿尔兹海默疾病(Alzheimer's disease)相关疾病的人类蛋白,并找出与之能发生相互作用的蛋白质,绘制一个有关人类AD相关蛋白质相互作用网络.分析和计算了该网络的一些详细属性,并对网络进行生物信息学分析,找出网络中的蛋白质调控路径,该路径可能涉及到Apoptosis-antagonizing transcription factor(AATF)蛋白对于阿尔兹海默疾病的抑制作用.几个潜在与AATF蛋白作用的位点被自己开发的程序预测出,将它们的潜在作用位点做了比对,最后得到一个高度收敛的序列模体,其正则表达式为I-x(0,D-E-x(2)-[AENT]-x-[EK].

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨洁	南京大学生物医药技术国家重点实验室	60	325	9.0	16.0
2	王炜	南京大学物理系	54	286	9.0	14.0
3	蒋雄飞	南京大学生物医药技术国家重点实验室	1	6	1.0	1.0