荧光定量PCR检测细菌染色体上基因拷贝数

• 作者: 刘广文 梁未丽 闫梅英 阚飙 高守一
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 荧光定量PCR 基因拷贝数 霍乱弧菌
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 免疫检测
• 页码范围: 379-382
• 页数: 4页
• 分类号: R392
• 字数: 3895字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2006.04.022

摘要

目的建立一种以细菌染色体上1个已知拷贝管家基因作为基准、通过荧光定量PCR检测其他被检基因拷贝数的方法.方法利用荧光定量PCR检测El Tor型霍乱弧菌染色体上目的基因zot与基准基因thyA的Ct(threshold cycle)值差值,根据已知拷贝数菌株N16961的两基因Ct值之差来推算待测菌株中zot基因的拷贝数.结果利用thyA基因作参照,确定11株E1 Tor型霍乱弧菌中zot基因的拷贝数在1～5个之间,对较少拷贝数的检测与Southern blot确认的相同,对多拷贝数检测优于Southern blot的判定.结论本方法可以准确检测菌株染色体上的基因拷贝数.