萝卜基因组DNA的RAMP-PCR体系优化

• 作者: 李培 柳李旺 王明霞 赵丽萍 龚义勤
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 萝卜 RAMP标记 体系优化 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2006,（1）
• 页码范围: 93-97
• 页数: 5页
• 分类号: Q94
• 字数: 3860字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-5102.2006.01.020

摘要

以萝卜为材料,对基因组DNA的RAMP分析体系中的Mg2+、dNTPs和引物浓度进行优化.分别设计3个浓度梯度:Mg2+为 0.75、1.5、3.0 mmol·L-1;dNTPs为 0.05、0.15、0.3 mmol·L-1;引物为 0.065、0.2、0.4 μmol·L-1,并对合适退火温度进行研究.筛选出的RAMP优化体系为(20 μL):dNTPs 0.15 mmol·L-1,Mg2+ 1.5 mmol·L-1,引物 0.2～0.4 μmol·L-1,DNA 10 ng,Taq E 0.8U;PCR扩增程序为94℃ 3 min,94℃ 1 min,45℃ 1 min,72℃ 1.5 min,42个循环, 72℃ 8 min.运用此体系,进行引物组合筛选,并对7个萝卜品种的遗传多样性与品种鉴定进行RAMP标记分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	龚义勤	南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室南京农业大学园艺学院	41	866	15.0	29.0
2	柳李旺	南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室南京农业大学园艺学院	53	1052	15.0	31.0
3	赵丽萍	南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室南京农业大学园艺学院	4	75	4.0	4.0
4	王明霞	南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室南京农业大学园艺学院	3	61	2.0	3.0
5	李培	南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室南京农业大学园艺学院	1	17	1.0	1.0