Armillariella tabescens阿拉伯糖苷酶基因全长cDNA的克隆与表达

• 作者: 刘大岭 姚冬生 梁郁强 谢春芳 黄辉
• 来源期刊: 暨南大学学报（自然科学与医学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 假密环菌 阿拉伯糖苷酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2006,（3）
• 页码范围: 476-482
• 页数: 7页
• 分类号: Q7
• 字数: 3872字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-9965.2006.03.027

摘要

通过对假密环菌(Armillariella tabescens)的表达cDNA克隆文库进行随机测序,获得一段与多形拟杆菌的阿拉伯糖苷酶序列同源性很高的EST序列(AJ620046).根据获得的EST序列用SMART-RACE技术成功从假密环菌中克隆出了阿拉伯糖苷酶基因的全长cDNA,用生物信息学的方法对所获的序列进行信息学分析.分析结果显示其全长cDNA为1 016 bp,其最长的开放阅读框架为924 bp,编码307个氨基酸,该全长cDNA序列与多形拟杆菌的阿拉伯糖苷酶序列具有较高同源性,80～279位氨基酸序列属于阿拉伯糖苷酶超家族,58～184位氨基酸是一个典型的结构功能域,蛋白分子质量预测为32 881 u,等电点为4.59.构建重组质粒pPIC9-AF,并在毕赤酵母菌GS115中对所获得的基因进行了表达,相对酶活达到了81.25%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚冬生	暨南大学生物工程学系	43	293	9.0	14.0
2	刘大岭	暨南大学生物工程学系	33	277	10.0	14.0
3	谢春芳	暨南大学生物工程学系	24	202	9.0	13.0
4	梁郁强	暨南大学生物工程学系	19	313	10.0	17.0
5	黄辉	暨南大学生物工程学系	5	23	3.0	4.0