日本百脉根牻牛儿基牻牛儿基氢化酶的电子克隆及进化分析

• 作者: 李晓晓 李蕊 李雅轩 胡英考 蔡民华
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 日本百脉根 (牛尨)牛儿殆(牛尨)牛儿基氢化酶(GGH) 电子克隆 EST
• 年，卷（期）: 2006,（23）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 6145-6147,6150
• 页数: 4页
• 分类号: Q55
• 字数: 2812字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2006.23.034

摘要

根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学的方法,以拟南芥(牛尨)牛儿基(牛尨)牛儿基氢化酶(GGH)基因cDNA序列为信息探针,搜索GenBank中的HTGs数据库,找到一个与之高度匹配的日本百脉根基因组DNA序列LJT46M09,用GENSCAN软件分析该序列得到一个包含2个外显子和1个内含子的基因.以此基因序列 BLAST检索GenBank中的est-others数据库获得了同源的EST片段.进行EST拼接后得到该基因的cDNA序列,GenBank登录号为DQ013361,由1 389 bp核苷酸组成,具有完整的开放阅读框架(ORF),推测编码蛋白为462个氨基酸.推导的氨基酸序列与大豆、截形苜蓿、烟草、拟南芥、小麦、水稻的(牛尨)牛儿基(牛尨)牛儿基氢化酶基因氨基酸序列的一致率分别为91%、89%、84%、81%、73%、74%.该基因与叶绿素等的生物合成有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡英考	首都师范大学生命科学学院	41	609	15.0	23.0
2	李雅轩	首都师范大学生命科学学院	43	499	14.0	20.0
3	蔡民华	首都师范大学生命科学学院	31	341	11.0	17.0
4	李蕊	首都师范大学生命科学学院	7	78	4.0	7.0
5	李晓晓	首都师范大学生命科学学院	5	43	3.0	5.0