基于转录组信息的艾纳香牻牛儿基焦磷酸合成酶基因(BbGPPS)的克隆及序列分析

• 作者: 夏奇峰 官玲亮 庞玉新 石小兵 蓝惠萍 赵致 陈振夏
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 艾纳香 牻牛儿基焦磷酸合成酶 氨基酸序列 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 901-909
• 页数: 9页
• 分类号: S567|Q78
• 字数: 3953字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2016.05.009

摘要

采用RT-PCR和RACE(Rapid amplification of cDNA ends)技术,从艾纳香(Blumea balsamifera L.DC)的叶片中克隆到单萜化合物合成的关键酶牻牛儿基焦磷酸合成酶(BbGPPS)基因.研究结果显示,BbGPPS基因的cDNA全长1 692 bp,包含开放阅读框(ORF)1 083 bp,编码361个氨基酸;亚细胞结构定位于叶绿体,既非膜蛋白也非分泌性蛋白.疏水性分析显示,BbGPPS是亲水性蛋白.同源性比对结果显示,BbGPPS蛋白与其他植物中GPPS蛋白具有高度的相似性,且具有异戊烯基结构域.系统发育分析表明,所有序列被聚为5大类,BbGPPS与其他菊科植物聚类一类,与万寿菊(Tagetes erecta)TeGPPS亲缘关系最近,其次是甜菊(Stevia rebaudiana)SrGPPS.