植物萜类合成酶1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶的分子结构特征与功能预测分析

• 作者: 李嵘 王喆之
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 植物萜类合成 1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶(DXR) 分子结构 功能预测 生物信息学
• 年，卷（期）: 2007,（1）
• 页码范围: 59-67
• 页数: 9页
• 分类号: Q94
• 字数: 5203字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-5102.2007.01.012

摘要

采用生物信息学的方法和工具对已在GenBank上注册的拟南芥、玉米、岩蔷薇、水稻、黄花蒿、亚麻等植物的萜类合成酶1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶的核酸及氨基酸序列进行分析,并对其组成成分、转运肽、跨膜拓朴结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化关系等进行预测和推断.结果表明:该类酶基因的全长包括5′、3′非翻译区和一个开放阅读框,无跨膜结构域,是一个具转运肽的亲水性蛋白,包括两个功能DXR结合motif及两个功能NADPH结合motif,α-螺旋和不规则卷曲是蛋白质二级结构最大量的结构元件,β-转角和β-折叠散布于整个蛋白质中,蛋白质的功能域在空间结构上折叠成"V"形,"V"形的两臂由N-端与C-端构成,"V"形的底部,是N-端臂与C-端臂的结合域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王喆之	陕西师范大学生命科学学院	155	1966	25.0	35.0
2	李嵘	陕西师范大学生命科学学院	6	168	5.0	6.0