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摘要:
旨在克隆滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶基因GrDXS,并进行表达分析。以滇龙胆转录组为基础,采用RT-PCR技术从滇龙胆幼叶克隆GrDXS基因,并进行原核表达和组织特异性表达分析。滇龙胆GrDXS基因(登录号:KJ624995)全长2145 bp,编码714个氨基酸;GrDXS蛋白相对分子质量76.75 kD,pI为6.93;属于DXS家族成员,可能定位于叶绿体;主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;具有DXS蛋白的4类保守结构域:焦磷酸硫胺素结合折叠域(IPR029061,69-425、366-555、87-268、315-407、407-558)、类转酮酶嘧啶结合结构域(IPR005475,394-559、394-555)、转酮酶C端/丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶结构域II(IPR009014,568-704,572-704)、转酮酶C端结构域(IPR005476,573-696)和1个转酮酶结合位点(IPR020826,500-516);与长春花CrDXS蛋白亲缘关系最近;GrDXS基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为100 kD,与预期蛋白大小一致;GrDXS基因主要在叶中表达。
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文献信息
篇名 滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶基因的克隆与表达分析
来源期刊 生物技术通报 学科
关键词 滇龙胆 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶 生物信息学 表达模式
年,卷(期) 2016,(4) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 128-136
页数 9页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.04.017
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王元忠 云南省农业科学院药用植物研究所 162 905 14.0 19.0
2 张晓东 玉溪师范学院资源环境学院 31 71 5.0 7.0
3 李彩霞 玉溪师范学院资源环境学院 19 43 4.0 6.0
4 张海晨 玉溪师范学院资源环境学院 3 8 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
滇龙胆
1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸合酶
生物信息学
表达模式
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