人胎儿骨膜全长cDNA文库的构建及测序

• 作者: 刘勇 宫伟雁 林守清 王绍海 郑睿敏
• 来源期刊: 医学分子生物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 全长cDNA文库 末端模板转换技术 DNA测序 生物信息分析
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 319-323
• 页数: 5页
• 分类号: Q523
• 字数: 3803字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3870/j.issn.1672-8009.2007.04.009

摘要

目的 构建人胎儿的骨膜组织的全长cDNA文库,了解该组织表达谱的特征.方法 以胎儿胫骨骨膜为材料,运用末端模板转换技术(SMART)构建cDNA文库,测定库容量并应用菌落PCR的方法确定平均插入片段长度,随后大规模测序并进行生物信息学处理分析.结果 所构建的cDNA文库的库容量为5.2×106,平均插入片段的长度为1.2 kb.随机测序了25 000余个克隆的序列,拼接后为5 230个聚类群(contigs)和4 714个独立EST(singleton),Blast比对分析得到骨膜基因表达谱的概况,发现了23个候选的新基因.结论 构建的骨膜组织的cDNA文库质量满足后续工作的需要,骨膜组织基因表达谱及一些新基因的获得为今后寻找骨膜组织特异性的基因从而研究骨相关疾病的发病机制、发现具有药物开发靶点的功能基因奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王绍海		14	114	6.0	10.0
3	林守清		34	289	9.0	15.0
4	刘勇		6	23	3.0	4.0
7	宫伟雁		1	9	1.0	1.0
8	郑睿敏		1	9	1.0	1.0