用鲤鱼EST-SSRs分子标记分析长江黑龙江鲤种群结构

• 作者: 全迎春 孙效文 李大宇 梁利群 鲁翠云
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鲤鱼EST-SSRs 微卫星 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 947-952
• 页数: 6页
• 分类号: S188
• 字数: 4462字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2007.06.007

摘要

从鲤鱼(Cyprinus carpio)ESTs的数据库(10 691个)中进行微卫星序列筛选,共发现微卫星序列127个,占整个ESTs数据库的1.19%;另外从本研究室构建的鲤鱼脑组织cDNA文库中筛选到微卫星序列20个.根据筛选得到的微卫星序列设计引物68对,合成引物40对,其中27对引物能够获得预期的目的片段,20对引物在所检测的群体内及群体间表现出多态性.用此20对引物标记的多态性分析了长江鲤(Cyprinus carpio)和黑龙江鲤(C. carpio var haematopaerus.Temminck et Schlegel)的群体遗传结构,结果表明:长江鲤和黑龙江鲤在多数位点表现出较高的遗传多样性,20个位点的平均有效等位基因数分别为3.9135和3.4820;平均观察杂合度为0.6067和0.5667;平均期望杂合度为0.6737和0.6194;平均多态信息含量为0.6308和0.5714.长江鲤的遗传结构好于黑龙江鲤,两个群体的Hardy-Weinberg偏离指数较小,群体基本保持平衡,群体结构较合理;其中HLJE1和HLJE10位点在长江鲤和黑龙江鲤的扩增结果相差较大,长江鲤的多态性明显高于黑龙江鲤,位点多态信息含量相差1倍以上,可用于群体的鉴别.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙效文	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	159	3935	35.0	57.0
2	梁利群	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	91	2491	28.0	47.0
3	全迎春	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	5	123	4.0	5.0
4	鲁翠云	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	47	1092	18.0	32.0
5	李大宇	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	10	141	5.0	10.0