猪源冠状病毒ORF3和ORF7的克隆及特性分析

• 作者: 兰喜 吴润 李宝玉 李建强 柳纪省 殷相平 程杰 胡永浩
• 来源期刊: 甘肃农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪源冠状病毒 传染性胃肠炎病毒 ORF3 ORF7 克隆
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 动物科学·动物医学
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: S851.347.101
• 字数: 3596字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-4315.2007.06.001

摘要

参照GenBank中Purdue株全序列对TGEV(猪传染性胃肠炎病毒)TS株的ORF3和ORF7各设计1对特异性引物,经RT-PCR扩增分别获得了1 487 bp和516 bp大小的两个片段,与预期结果大小相符.TS株与CHV株、Puedue株、BW021898B株和KT2株的ORF3a核苷酸序列同源性分别为99.1%、93.0%、95.9%、94.4%,相应的氨基酸同源性分别为97.3%、87.8%、93.2%、91.8%,TS株与CHV株、Puedue株、BW021898B株和KT2株的ORF3b核苷酸序列同源性分别为99.5%、98.5%、97.0%、97.8%,相应氨基酸的同源性分别为98.4%、96.3%、94.3%、95.8%,而TS株与PRCV IA1894株的ORF3b核苷酸和氨基酸同源性分别为96.6%和93.9%.TS株ORF7没有发生缺失且和其他毒株有很高的同源性.结果表明:TGEV非结构蛋白高变区在ORF3a第192个碱基至终止密码子之间,TGEV和PRCV在编码ORF3b氨基酸的数量和RNA酶结合位点上有一定的差异.