口蹄疫病毒AF72株3D聚合酶的三维结构模拟和功能分析

• 作者: 刘力宽 吕建亮 张中旺 张昱 张永光 张淑刚 方玉珍 李正丰 杜进鑫 潘丽 王永录 蒋守田
• 来源期刊: 中国兽医科学
• 学科: 农学
• 关键词: 口蹄疫病毒 3D聚合酶 三维结构 活性位点
• 年，卷（期）: 2008,（10）
• 所属期刊栏目: 病原生物学
• 页码范围: 842-846
• 页数: 5页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 4493字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4696.2008.10.004

摘要

为了研究口蹄疫病毒(FMDV)3D聚合酶的结构和功能,以A型FMDV AF72株RNA为模板,反转录并扩增目的基因,将PCR纯化产物与pGEM-T Easy栽体连接并转化JM109菌株,对经凝胶电泳、PCR和EcoR I酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序.并与GenBank中登录的其他4株FMDV完整参考序列进行比较,以确定AF72株3D聚合酶的核苷酸和氨基酸序列的保守区域,然后利用同源建模的方法建立AF72株3D聚合酶的三维结构.结果显示,3D聚合酶含有孔状活性区域.拉马钱德兰图证明,构建的3D聚合酶的空间结构是合理的.