亚麻纤维素合成酶及其类蛋白基因部分序列的克隆

• 作者: 何东锋 周小云 王进 邓欣 陈信波 高原 龙松华
• 来源期刊: 中国麻业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 亚麻(LinumusitatissimumL.) CesA基因 CSLD基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2008,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·种质资源
• 页码范围: 293-297,310
• 页数: 6页
• 分类号: S563.2
• 字数: 2963字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-3532.2008.06.002

摘要

分离和克隆了亚麻纤维素合成酶基因(CesA)及其类蛋白D基因家族(CSLD)的部分序列,并对其进行生物信息学分析.纤维素合成酶类蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区.利用其它物种中CesA基因的保守序列设计简并引物,采用RT-PCR方法扩增基因片段,经多次重复测序,获得了6个CesA基因片段和5个CSL基因片段.应用ClustalW和NCBI数据库对获得的基因片段进行序列分析,它们分别属于CesA基因家族和CSLD基因家族.6个CesA基因片段之间核酸和蛋白的相似性分别在67%～88%和71%～98%之间.5个CSLD基因片段之间核酸和蛋白的相似性分别在68%～83%和76%～94%之间.推测LusiCesA1与LusiCesA3,LusiCesA4与LusiCesA5及LusiCSLD1与LusiCSLD2的亲缘关系较近.