缢蛏微卫星序列分离及特性分析

• 作者: 李家乐 牛东红 郑润玲
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 缢蛏 微卫星 磁珠富集 PCR
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 733-738
• 页数: 6页
• 分类号: S917.1|Q75
• 字数: 4026字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5174.2008.05.006

摘要

分析了缢蛏(Sinonovacula constricta)基因组文库中微卫星序列的特性及微卫星引物的遗传特征.采用磁珠富集珐和PCR 筛选法,以CA15为探针,快速分离含有微卫星序列的阳性克隆.结果表明,在筛选的210个白色菌落中,得到58个微卫星序列,阳性克隆率为27.6%,核心重复序列为两碱基和三碱基的微卫星居多,其中完美型占39.7%,非完美型39.7%,复合型占10.3%,非完美型与复合型共存的占10.3%.微卫星重复次数主要集中在20～40次之间,占66%,最高为63次.除探针中使用的CA重复单元外,还观察到AG/TC,AT/TA,AAC/TTG,CAA/GTT,TGA,AAT,AGAA,GTTT/CAAA,AAAT/TTTA,TTTC,CCTA,TCTA,TCCC,TGCC,GTTTCT,CTGTT,CACACC,TATACA,TTTTG的重复序列.利用Primer Premier5.0设计引物24对,经过初步筛选得到适合的微卫星引物18对,为今后未知微卫星标记的开发,群体遗传结构的分析,优良品种的选育提供基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李家乐	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	91	1011	19.0	27.0
2	牛东红	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	27	216	10.0	14.0
3	郑润玲	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	3	33	2.0	3.0