扁桃PGIP基因的克隆及其序列分析

• 作者: 曹秋芬 杨晓宇 樊新萍 武彦霞 田建保
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 扁桃 PGIP DNA 克隆 测序
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 54-59
• 页数: 6页
• 分类号: S662.9
• 字数: 3977字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-9980.2008.01.011

摘要

以晋扁一号扁桃Prunus dulcis Miller.)基因组DNA为模板,用已登录的扁桃PGIP(多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白)基因保守序列设计引物进行PCR扩增,得到了6个PGIP基因片段并克隆到PBS-T载体中.根据测序结果分析,可利用其中的3个片断,分别命名为PdPGIP1(717 bp),PdPGIP2(864 bp)和PdPGIP3(796 bp),与公共数据库中的序列相似性比较,其中PdPGIP2和PdPGIP3各包含2个外显子和1个内含子,内含子符合GT-AG规律.其核苷酸序列分别与Genbank中登录的3个扁桃以及桃(P.persica Linn.)、杏(P.armeniaca Linn.)、美洲李(P.americana Marsh.)、中国李(P.salicina Lindl.)、马哈利樱桃(P.mahaleb Linnaeus)、苦樱桃(P.emarginata Walp.)、梅(P.mume Sieb.)的mRNA、DNA序列显示出极高的同源性,基本都在90%以上,其中PdPGIP1、PdPGIP2、PdPGIP3与Genbank中登录的3个扁桃PGIP基因的同源性为92%～99%.对氨基酸序列保守性分析发现,含有多数植物PGIP抗病基因表达蛋白特有的亮氨酸重复序列.证明我们所克隆的目的片段为PGIP基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹秋芬	山西省农业科学院生物技术中心	92	817	16.0	22.0