白桦雌花序抑制性消减文库构建及EST分析

• 作者: 姜静 杨传平 王超 魏继承
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 白桦 发育 表达序列标签 雌花 抑制性消减文库
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 页码范围: 293-298
• 页数: 6页
• 分类号: Q78
• 字数: 4168字
• 语种: 中文

摘要

为研究白桦雌花序发育过程中特异基因的表达,以白桦雌花序样品为tester,雄花序样品为driver,利用SMART策略构建了白桦雌花序抑制性消减(SSH)文库.构建SSH文库的重组率为72%,插入片段的平均长度为400 bp左右.随机挑选文库克隆测序,获得150条EST序列,这些序列被GenBank的dbEST数据库收录,收录号为EE284580-EE284681,EE595316-EE595363.通过BlastX对EST进行功能注释,并对其中同源性较高的111条EST按功能进行分类,EST功能涉及了代谢、细胞防御、转录调节、能量代谢及信号传导等途径.发现了多个已知的控制花发育相关的EST,它们占已知功能EST的21%其功能涉及到调控花序形成和花分化、调控花粉与柱头亲和性以及调控花粉管发育等,包括MADS-box、S-locus F-box等基因.这些EST的获得为了解白桦花期基因表达,白桦花发育相关基因克隆和功能解析奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨传平	东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室	231	4191	35.0	51.0
2	姜静	东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室	93	2233	27.0	43.0
3	魏继承		30	104	7.0	8.0
4	王超	东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室	44	161	8.0	10.0