弓形虫缓殖子期特异抗原SAG2C基因的克隆、鉴定与生物信息学分析

• 作者: 吴焜 杨培梁 程璐 陈晓光
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 弓形虫 缓殖子 期特异抗原 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 硕博专栏论著
• 页码范围: 193-197,200
• 页数: 6页
• 分类号: R382.5
• 字数: 4621字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2008.03.002

摘要

目的 克隆并鉴定弓形虫PRU株表面抗原SAG2C基因序列和cDNA序列,对比不同毒力弓形虫株(PRU、RH、ME49)中SAG2C基因序列,进行生物信息学分析.方法 根据SAG2C基因已知序列设计合成一对引物,应用PCR技术从Prugniaud(PRU)株弓形虫基因组DNA和总RNA中扩增SAG2C基因,克隆入pMD19-T载体并进行序列测定.应用DNAMAN软件、NCBI网站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)分析3种虫株之间SAG2C基因的同源性;利用生物信息学网站ExPASy(http://us.expasy.org/)对获得的基因及推导出的氨基酸序列进行生物信息学分析.结果 PCR扩增得到弓形虫PRU株SAG2C基因及其全长cDNA序列,酶切及PCR鉴定获得了正确的重组质粒,测序结果表明,获得SAG2C基因序列1 225 bp,全长cDNA序列1 095 bp.编码364个氨基酸.同源性分析显示,弓形虫Prugniaud株和RH株SAG2C基因同源性为97.14%:Prugniaud株与ME49株cDNA序列同源性为96.89%;编码氨基酸序列同源性为92%.N端为信号肽,C端疏水序列预测它为糖基磷脂酰肌醇固着蛋白,存在13个潜在抗原表位及多个保守功能区域.结论 成功克隆了弓形虫缓殖子期特异抗原SAG2C基因序列及其全长cDNA序列,序列分析显示其为糖基磷脂酰肌醇固着蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈晓光	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物学系	92	699	14.0	19.0
2	吴焜	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物学系	22	160	7.0	11.0
3	程璐	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物学系	14	74	6.0	8.0
4	杨培梁	南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物学系	21	153	7.0	11.0