在高压诱导蛋白质变性过程中水产生的压缩对它的影响

• 作者: 于家峰 王吉华 窦相华
• 来源期刊: 原子与分子物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 高压 压缩系数 分子动力学模拟 去折叠 小蛋白
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 833-837
• 页数: 5页
• 分类号: Q61
• 字数: 3259字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-0364.2008.04.017

摘要

实验表明水的压缩系数随着压强的改变会发生变化,这种改变将对高压致蛋白质变性的充分含水动力学模拟结果产生直接影响,然而很多高压变性的分子动力学模拟并没有考虑这一点.在温度为300 K,压强为200 MPa、1000 MPa时,利用GROMACS软件包对两种小蛋白Chignolin和Trpcage进行了总计300ns的分子动力学模拟,模拟中考虑了水的压缩系数随压强的改变情况,然后将模拟结果与压缩系数维持在O.1 MPa时的情况进行了比较.结果发现,压缩系数对蛋白质高压变性的影响很大,依据实验数据对不同压强的压缩系数进行调整后,小蛋白Chignolin在高压变性中出现完全去折叠.这为分子动力学模拟研究蛋白质高压变性提供了正确的途径和理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王吉华	德州学院物理系	48	136	6.0	9.0
2	于家峰		2	3	1.0	1.0
3	窦相华		2	3	1.0	1.0