香蕉EST-SSRs标记的开发与应用

• 作者: 刘伟良 武耀廷 王静毅 陈业渊
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: 香蕉 EST EST-SSR 遗传多样性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2008,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 933-940
• 页数: 8页
• 分类号: Q94
• 字数: 4553字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2008.07.020

摘要

从NCBI搜索的2 282条香蕉EST中,发掘出含有SSR的EST序列110条,共有122个SSR位点,检出率为5.3%.SSR位点可分为37种重复单元,平均长度为20bp,其中二、三核苷酸重复单元的SSR占主导地位,分别占总SSR的33.1%和47.6%.GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的75.7%和36.0%;其他重复类型所占比例均不足10%,而四核苷酸重复类型最少,为4.0%.设计的63对EST-SSRs引物中,有41对EST-SSRs引物对巴西蕉基因组DNA能扩增出产物,占总引物数的65.1%.应用进一步筛选出的重复性好、多态性高的19对引物对49个香蕉品种(系)进行PCR扩增.每对引物扩增的多态性带数目为4～12个,平均7.58个;引物多态信息量变化范围为0.3572～0.8744,平均0.7324.在相似系数为0.63的水平可将49个品种聚为2个类群:一类为含B基因组香蕉品种;另一类为不含B基因组的香蕉品种,表明EST-SSR引物可以应用于香蕉品种资源分类的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王静毅	中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所	19	190	7.0	13.0
2	陈业渊	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	125	1269	19.0	29.0
3	武耀廷	海南大学农学院热带园艺植物资源与遗传改良教育部重点实验室	8	73	3.0	8.0
4	刘伟良	中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所	3	86	3.0	3.0