应用CGH数据和树模型探索癌症的发病机理

• 作者: 吕炳建 李小波 来茂德 陈俭
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 医学
• 关键词: 癌症发病机理 比较基因组杂交(CGH) 树模型 分支树 距离树
• 年，卷（期）: 2008,（4）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 407-412
• 页数: 6页
• 分类号: R73
• 字数: 5281字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0253-9772.2008.04.004

摘要

比较基因组杂交技术(comparative genomic hybridization,CGH)主要用于检测肿瘤的染色体缺失和扩增,迄今已积累了大量的实验数据,为全基因组分析肿瘤的发生机制提供了可能,树模型在生物信患学领域通常被用于研究生物形成和进化的历史,物种之间的进化关系常以系统发生树来表示,树模型同样可以作为一种有力的生物信息学工具来分析CGH数据,探索癌症的发病机理.文中介绍了两种常见的树模型-分支树和距离树,详细叙述了重建树模型的基本原理和方法,分析了创建树模型时要注意的几个技术问题,并对其在肿瘤研究中的应用进行了回顾和总结.肿瘤的树状模型作为单路径线性模型的泛化,克服了以往单路径线性模型的缺点,理论上能更加精确地概括到肿瘤的多基因、多路径,多阶段的发生发展模式,从不同角度探讨肿瘤发生发展的分子机制,该模型除可用于分析肿瘤的CGH数据外,还可用于分析其他多种类型的数据,包括微阵列CGH(array-CGH)技术等产生的高分辨率数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	来茂德	浙江大学医学院病理学与病理生理学系	128	1122	16.0	26.0
2	吕炳建	浙江大学医学院病理学与病理生理学系	36	172	8.0	12.0
3	陈俭	浙江大学医学院病理学与病理生理学系	36	216	9.0	13.0
4	李小波	浙江大学医学院病理学与病理生理学系	4	11	2.0	3.0