磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的生物信息学分析

• 作者: 任源浩 杨平 蔡小宁 陈茜
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC) 生物信息学
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 914-916
• 页数: 3页
• 分类号: Q55
• 字数: 2607字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2008.03.035

摘要

[目的]为改造磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因、提高PEPC活性寻找线索.[方法] 对GenBank上登录的PEPC的cDNA序列、氨基酸序列进行BLAST搜索,运用生物信息学方法进行信号肽分析、亚细胞定位、结构域分析以及PEPC蛋白质氨基酸序列的同源性分析和系统进化树分析.[结果] 共搜寻到62个PEPC蛋白质序列,绝大多数属于C3植物,9个属于C4 植物.绝大多数PEPC没有存在信号肽的可能性.62个PEPC蛋白的亚细胞定位基本一致,均具有Phosphoenolpyruvate carboxylase结构域,未发现其他结构域.通过进化树分析可分别将C3 植物和C4植物的PEPC酶分成4组和3组.62个PEPC蛋白质氨基酸序列的同源性为86.70%,而其在19个C3 植物和9个C4 植物中则分别为89.63%和89.61%.[结论] C4植物PEPC的423位上的丙氨酸和862位上的酪氨酸高度保守,而C3 植物的428位和871位的氨基酸则缺少同源性,可能与C3 和C4植物PEPC的活性差异有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨平	南京晓庄学院生命科学系	49	163	7.0	10.0
2	蔡小宁	南京晓庄学院生命科学系	33	265	10.0	15.0
3	任源浩	南京晓庄学院生命科学系	26	109	6.0	9.0
4	陈茜	南京晓庄学院生命科学系	1	17	1.0	1.0