A组人轮状病毒DQ-1株VP7基因序列和蛋白质结构分析

• 来源期刊: 山西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 轮状病毒 VP7结构蛋白 基因序列 蛋白质结构
• 年，卷（期）: 2009,（10）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 877-881
• 页数: 5页
• 分类号: R512.5
• 字数: 3744字
• 语种: 中文

摘要

目的 研究DQ-1株VP7基因的基因分型,对DQ-1株VP7基因序列和糖蛋白VP7的蛋白质结构进行分析. 方法 通过RT-PCR技术扩增人A组轮状病毒DQ-1株VP7全长基因,并将RT-PCR产物连接到pMD18-T载体,转化大肠杆菌JM109感受态细胞,在含有氨苄青霉素的LB琼脂培养基上筛选出两个PCR阳性菌落,并提取质粒,双酶切鉴定,最后利用通用引物进行测序. 结果 DQ-1株VP7基因与同型的我国已测序G1型地方株T73、R96-197株基因序列同源性均为97.6%,与G1型标准株Wa株核苷酸序列同源性为92.9%,与G2血清型代表株DS-1株基因序列同源性为73.8%,与G3血清型代表株SA11株核甘酸序列同源性为75.6%;其VP7基因mRNA可折叠多达20个发卡结构.DQ-1株氨基酸序列与T73、R96-197株同源性都达97.5%,与Wa株达94.6%,而与其他型DS-1株、SA11株和J-4621株分别仅为74.4% ,79.4%和75.2%. 结论 DQ-1株属于G1血清型.DQ-1株VP7基因序列与已测序我国G1型地方株VP7基因序列几乎没有差别,而与G1型标准株VP7基因序列存在细微差异.