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摘要:
针对大规模、高通量方法识别出的蛋白质相互作用数据集包含噪声较高的问题,根据蛋白质相互作用网络中噪声数据的特点和网络拓扑属性,提出了一种基于极大团的相互作用预测方法以提高识别出的这种数据集的可靠性.该方法通过蛋白质与蛋白质团之间的关联程度来预测蛋白质间是否存在相互作用,同时结合噪声数据在网络中的特点将预测结果放大并将伪相互作用分离出来,最后可获得可靠性较高的预测数据集.实验结果显示,所提出的方法不仅可以预测更多相互作用而且具有更高的可靠性.
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分类
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阈值方法
关键蛋白质识别
基于蛋白质相互作用网络预测癌症致病基因
疾病基因
癌症
蛋白质相互关系
预测
内容分析
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文献信息
篇名 一种基于极大团的蛋白质相互作用预测方法
来源期刊 高技术通讯 学科 生物学
关键词 蛋白质相互作用网络 相互作用预测 假阳性 极大团
年,卷(期) 2009,(1) 所属期刊栏目 资源环境与生物技术
研究方向 页码范围 82-88
页数 7页 分类号 Q5
字数 6566字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王建新 中南大学信息科学与工程学院 371 3185 23.0 39.0
2 李敏 中南大学信息科学与工程学院 116 690 14.0 20.0
3 蔡钊 中南大学信息科学与工程学院 1 3 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
蛋白质相互作用网络
相互作用预测
假阳性
极大团
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
高技术通讯
月刊
1002-0470
11-2770/N
大16开
北京市三里河路54号
82-516
1991
chi
出版文献量(篇)
5099
总下载数(次)
14
总被引数(次)
39217
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导