山药SuSy基因全长cDNA序列的结构、进化和表达

• 作者: 向殉 周生茂 方锋学 曹家树 李文嘉 李杨瑞 王玲平 韦本辉
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大薯(Dioscorea alata) 蔗糖合成酶 基因克隆 结构特征 分子进化 表达分析
• 年，卷（期）: 2009,（7）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 2458-2468
• 页数: 11页
• 分类号: S6
• 语种: 中文

摘要

[目的]阐明山药蔗糖合成酶(SuSy,EC 2.4.1.13)基因家族的成员及其功能.[方法]利用RT-PCR和RACE技术从大薯(Dioscorea alata)地下块茎中分离到1个SuSy基因(DaSuSy1)全长cDNA序列,并用DANSTAR和Clastal W等软件分析该序列的结构特征和分子进化,采用RT-PCR和Northern杂交对该基因的时空表达进行分析.[结果]DaSuSy1全长cDNA序列大小为2 673 bp,其中最大开放阅读框(ORF)、5'端和3'端的非翻译区分别含有2 445 bp、7 bp和221 bp,而且3'端的非翻译区含1个24 nt的Poly(A+)尾;最大ORF可编码814个氨基酸,分子量为92.76 kD,等电点为6.42,含有蔗糖合成酶和葡糖基转移酶两个保守功能域及两个磷酸化位点,即N端的Ser10和C端的SNLDRRET781 RR(Ser774～Thr781).该基因在全长cDNA序列、编码区cDNA序列及其编码氨基酸序列的水平上与GenBank中所选已知物种SuSy基因相应序列的同源性分别达45.3%～71.3%、45.8%～74.8%和50%～84.7%,与禾本科植物SuSy基因家族中一些成员亲缘关系最近.DaSuSy1在非光合器官中表达,其中地下块茎表达最为强烈,而且从块茎形成初前期开始表达一直增强至盛中期,此后逐渐减弱.[结论]DaSuSy1是山药SuSy基因家族成员,归为单子叶植物SuSy基因的组别,仅在非光合器官中表达编码负责蔗糖-淀粉转化功能的SuSy同工型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹家树	浙江大学蔬菜研究所	144	2996	30.0	48.0
2	王玲平	浙江省农业科学院蔬菜研究所	13	240	7.0	13.0
3	方锋学	广西壮族自治区农业科学院蔬菜研究所	3	13	2.0	3.0
4	韦本辉	广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所	2	10	1.0	2.0
5	向殉	浙江大学蔬菜研究所	3	51	3.0	3.0
6	周生茂	浙江大学蔬菜研究所	3	59	3.0	3.0
8	李杨瑞	广西壮族自治区农业科学院省重点实验室	4	25	2.0	4.0