实时定量PCR阵列检测小鼠大脑组织microRNA表达谱

• 作者: 何湘君 刘玉京 张旗 潘秀英 马丽萍
• 来源期刊: 北京大学学报医学版
• 关键词: 微RNAs 基因表达谱 逆转录聚合酶链反应 小鼠
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 152-157
• 页数: 6页
• 分类号: R34
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-167X.2009.02.007

摘要

目的:分析小鼠大脑组织microRNA(miRNA)表达谱,为研究特定miRNA及其靶基因、中枢神经系统miRNA相关的调节网络,以及miRNA在中枢神经系统疾病中的作用提供参考.方法:采用RNA加尾和引物延伸序列RT-PCR法,将精心设计的特异引物按Tm值排成阵列,用梯度实时PCR仪在不同的退火温度扩增每一个miRNA,并计算出每种miRNA相对于内参的表达量.结果:共检测了285个miRNA,阳性者260个,它们丰度不同,频数分布图大致呈正态.大部分miRNA的表达水平与已发表的芯片结果一致,而阳性率高于芯片结果.源自同一miRNA前体的2个成熟miRNA表达量,有些相差无几,有些则相差甚多.同簇相邻miRNA的丰度有些相近,有些则差异明显,提示miRNA转录后的归宿决定其丰度.结论:采用实时定量PCR阵列法,分析了小鼠大脑组织的miRNA表达谱,特别是获得了一些低丰度miRNA在小鼠大脑中表达的数据,这将有助于对这些低丰度miRNA的功能研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘秀英	北京大学人民医院临床分子生物学研究所	10	104	5.0	10.0
2	何湘君	北京大学人民医院临床分子生物学研究所	27	242	10.0	14.0
3	马丽萍	北京大学人民医院临床分子生物学研究所	33	189	8.0	12.0
4	张旗	北京大学人民医院临床分子生物学研究所	21	188	8.0	13.0
5	刘玉京	北京大学人民医院临床分子生物学研究所	10	75	6.0	8.0