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幽门螺杆菌Cag-PAI hp0523基因的克隆及功能预测
幽门螺杆菌Cag-PAI hp0523基因的克隆及功能预测
作者:
田树伟
邵世和
钟桥
韩军
黄世腾
黄河
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
幽门螺杆菌
Cag致病岛
功能预测
溶菌糖基转移酶
摘要:
目的:明确幽门螺杆菌Cag-PAI hp0523基因的功能,探讨其在幽门螺杆菌致病中的作用.方法:设计引物,以幽门螺杆菌NCTC11637为模板,采用聚合酶链反应(PCR)扩增获得目的片段;将其进行T-A克隆后,进行测序.将该基因序列与其他菌株做BLAST比对分析,并结合生物信息学数据库和软件,分析其序列特征和理化特性.结果:经酶切,测序分析表明,插入的基因片断为510 bp,与基因库公布的幽门螺杆菌 26695及J99序列相比较,同源性高达 94%;软件预测其编码的蛋白为169个氨基酸,其相对分子质量约为19.7 kDa,等电点约为9.53;基序分析表明,在33~165位氨基酸之间存在一个保守的SLT催化基序,可能是溶菌糖基转移酶;对其催化能力进行预测,结果表明,HP0523(33.7%)催化能力可能较T4溶菌酶(32.3%)和溶菌酶SLT70(28.6%)的活性高.结论:成功克隆了幽门螺杆菌Cag-PAI的hp0523基因,对其序列进行了深入分析,为进一步研究其功能,阐明幽门螺杆菌Cag-PAI的致病机制奠定了基础.
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内容分析
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相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
幽门螺杆菌Cag-PAI hp0523基因的克隆及功能预测
来源期刊
江苏大学学报(医学版)
学科
医学
关键词
幽门螺杆菌
Cag致病岛
功能预测
溶菌糖基转移酶
年,卷(期)
2009,(2)
所属期刊栏目
检验医学
研究方向
页码范围
152-156
页数
5页
分类号
Q78|R392
字数
2880字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1671-7783.2009.02.016
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
邵世和
江苏大学基础医学与医学技术学院病原生物学研究室
99
382
9.0
14.0
2
黄河
江苏大学生命科学研究院
13
31
3.0
5.0
3
田树伟
江苏大学生命科学研究院
6
9
2.0
2.0
4
韩军
江苏大学生命科学研究院
6
9
2.0
2.0
5
黄世腾
江苏大学基础医学与医学技术学院病原生物学研究室
5
9
2.0
2.0
6
钟桥
江苏大学基础医学与医学技术学院病原生物学研究室
7
14
2.0
3.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(9)
共引文献
(2)
参考文献
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节点文献
引证文献
(1)
同被引文献
(12)
二级引证文献
(0)
1992(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
1996(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1998(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
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参考文献(1)
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2000(1)
参考文献(0)
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参考文献(1)
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参考文献(0)
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参考文献(1)
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参考文献(1)
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参考文献(0)
二级参考文献(1)
2007(2)
参考文献(2)
二级参考文献(0)
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参考文献(1)
二级参考文献(0)
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参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
2013(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
幽门螺杆菌
Cag致病岛
功能预测
溶菌糖基转移酶
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
江苏大学学报(医学版)
主办单位:
江苏大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1671-7783
CN:
32-1669/R
开本:
大16开
出版地:
江苏省镇江市梦溪园巷30号 出版楼5楼
邮发代号:
28-192
创刊时间:
1991
语种:
chi
出版文献量(篇)
4144
总下载数(次)
4
总被引数(次)
12843
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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