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摘要:
目的:明确幽门螺杆菌Cag-PAI hp0523基因的功能,探讨其在幽门螺杆菌致病中的作用.方法:设计引物,以幽门螺杆菌NCTC11637为模板,采用聚合酶链反应(PCR)扩增获得目的片段;将其进行T-A克隆后,进行测序.将该基因序列与其他菌株做BLAST比对分析,并结合生物信息学数据库和软件,分析其序列特征和理化特性.结果:经酶切,测序分析表明,插入的基因片断为510 bp,与基因库公布的幽门螺杆菌 26695及J99序列相比较,同源性高达 94%;软件预测其编码的蛋白为169个氨基酸,其相对分子质量约为19.7 kDa,等电点约为9.53;基序分析表明,在33~165位氨基酸之间存在一个保守的SLT催化基序,可能是溶菌糖基转移酶;对其催化能力进行预测,结果表明,HP0523(33.7%)催化能力可能较T4溶菌酶(32.3%)和溶菌酶SLT70(28.6%)的活性高.结论:成功克隆了幽门螺杆菌Cag-PAI的hp0523基因,对其序列进行了深入分析,为进一步研究其功能,阐明幽门螺杆菌Cag-PAI的致病机制奠定了基础.
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文献信息
篇名 幽门螺杆菌Cag-PAI hp0523基因的克隆及功能预测
来源期刊 江苏大学学报(医学版) 学科 医学
关键词 幽门螺杆菌 Cag致病岛 功能预测 溶菌糖基转移酶
年,卷(期) 2009,(2) 所属期刊栏目 检验医学
研究方向 页码范围 152-156
页数 5页 分类号 Q78|R392
字数 2880字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1671-7783.2009.02.016
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 邵世和 江苏大学基础医学与医学技术学院病原生物学研究室 99 382 9.0 14.0
2 黄河 江苏大学生命科学研究院 13 31 3.0 5.0
3 田树伟 江苏大学生命科学研究院 6 9 2.0 2.0
4 韩军 江苏大学生命科学研究院 6 9 2.0 2.0
5 黄世腾 江苏大学基础医学与医学技术学院病原生物学研究室 5 9 2.0 2.0
6 钟桥 江苏大学基础医学与医学技术学院病原生物学研究室 7 14 2.0 3.0
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研究主题发展历程
节点文献
幽门螺杆菌
Cag致病岛
功能预测
溶菌糖基转移酶
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
江苏大学学报(医学版)
双月刊
1671-7783
32-1669/R
大16开
江苏省镇江市梦溪园巷30号 出版楼5楼
28-192
1991
chi
出版文献量(篇)
4144
总下载数(次)
4
总被引数(次)
12843
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导