拟南芥和水稻SET结构域基因家族全基因组鉴定、分类和表达

• 作者: 张亮生 戢茜 王翼飞 马成荣
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 农学
• 关键词: 拟南芥 水稻 SET结构域基因 进化分析
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 186-198
• 页数: 13页
• 分类号: S5
• 字数: 6519字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2009.00186

摘要

SET(Su(var),Enhancer of zeste (E(z)),and Trithorax)结构域基因家族是一组含有保守SET结构域的蛋白的统称,它们参与蛋白甲基化,影响染色体结构,并且调控基因表达,在植物发育中起着重要的作用.分析拟南芥和水稻中SET结构域基因家族进化关系,对研究这一基因家族中各成员的功能有着重要的意义.我们系统地鉴定了47个拟南芥(Arabidopsis thaliana)和43个水稻(Orysa sativajaponica cultivar Nipponbare)的SET结构域基因,染色体定位和基因复制分析表明SET结构域基因扩增是由片段复制和反转录引起的,根据这些结构域差异和系统发育分析把拟南芥和水稻的SET结构域基因划分成5个亚家族.通过分析SET结构域基因家族在拟南芥和水稻各个发育阶段的表达谱,发现SET结构域基因绝大部分至少在一个组织中表达;大部分在花和花粉中高表达:一些SET结构域基因在某些组织中有特异的表达模式,表明与组织发育有密切的关系.在拟南芥和水稻中分别找到了4个差异表达基因.拟南芥4个差异基因都在花粉管高表达,水稻4个差异基因有3个在雄性花蕊中高表达.另一个在幼穗中高表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王翼飞	上海大学数学系	72	398	10.0	17.0
2	戢茜	上海大学生命科学学院	3	53	3.0	3.0
3	张亮生	上海大学数学系	2	38	2.0	2.0
4	马成荣	上海大学数学系	8	20	2.0	4.0