大豆LEA基因家族全基因组鉴定、分类和表达

• 作者: 李乐 李雅轩 杨兴露 胡英考 许红亮
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: LEA基因家族 全基因组鉴定 进化分析 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2011,（19）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 3945-3954
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.19.004

摘要

[目的]鉴定大豆全基因组中的LEA家族基因,对其进行定位、分类以及组织表达分析,为植物LEA基因的功能研究与利用提供基础.[方法]利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定并获得大豆LEA家族基因的全序列、定位和拷贝数信息；通过序列比对进行进化和分类分析；利用大豆发育表达芯片数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析.[结果]系统地分析鉴定了36个大豆的LEA家族基因,根据结构域的差异和系统发育分析将这些LEA基因分成8个亚家族.基因定位分析结果表明,这些基因分布于大豆的16条染色体上,启动子分析表明,几乎全部LEA基因的启动子区含有逆境反应顺式作用元件.各个发育阶段表达谱的分析结果表明,多数成员至少在一个组织中表达,1 0个差异表达的基因中有5个在种子发育时期优势表达,另外5个在其它部位优势表达.[结论]通过全基因组扫描,获得大豆基因组的36个LEA家族基因,它们分属于8个不同的亚家族,分布于16条大豆染色体上,启动子区含有逆境相关顺式作用元件,基因表达具有一定特异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡英考	首都师范大学生命科学学院	41	609	15.0	23.0
2	李雅轩	首都师范大学生命科学学院	43	499	14.0	20.0
3	许红亮	首都师范大学生命科学学院	2	36	1.0	2.0
4	李乐	首都师范大学生命科学学院	2	36	1.0	2.0
5	杨兴露	首都师范大学生命科学学院	1	36	1.0	1.0