大豆TPS基因家族全基因组鉴定、分类与表达分析

• 作者: 汪章勋 谢翎 黄勃
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 TPS家族基因 全基因组鉴定 进化分析 差异表达
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 160-167
• 页数: 8页
• 分类号: S565.103
• 字数: 4778字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2014.02.004

摘要

利用大豆基因组数据库,通过生物信息学分析,鉴定并获得大豆TPS家族基因所有成员的全序列、基因结构和定位信息.利用序列比对对大豆TPS家族基因进行进化和分类分析,同时通过soybase大豆发育表达芯片数据库相关信息,对该家族基因成员的组织表达谱进行了检测.研究结果表明,大豆基因组中含有20个TPS家族基因成员.系统发育分析将这些TPS基因分成了两个亚家族.基因定位分析表明,这些成员基因分别分布于大豆的14条染色体上.启动子分析表明,全部大豆TPS家族基因的启动子区都含有逆境反应顺式作用元件.转录水平芯片数据分析同时显示,大豆TPS家族基因大多在花、根、根瘤等组织中存在优势表达.该研究结果将促进大豆TPS家族基因的功能研究与利用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢翎	安庆师范学院生命科学学院	13	129	8.0	11.0
5	黄勃	安徽农业大学微生物防治省重点实验室	100	1053	19.0	26.0
6	汪章勋	安徽农业大学微生物防治省重点实验室	16	99	5.0	9.0