羊驼KIT基因exon10-19 cDNA的克隆、表达及生物信息学分析

• 作者: 姜俊兵 张巧灵 范瑞文 董常生
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 羊驼 KIT基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 493-499
• 页数: 7页
• 分类号: S813.1|Q344.13
• 字数: 3017字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0366-6964.2009.04.007

摘要

从羊驼皮肤中提取总RNA,利用RT-PCR技术,扩增了羊驼显性白毛控制基因(KIT)cDNA序列(DQ450844),并与其它动物相应区域作了同源性比较,结果表明:羊驼KIT基因exon10-19 cDNA长1 044 bp,编码含347个氨基酸残基的蛋白;蛋白质同源性比较显示,羊驼与牛、羊、猪、人、马、猩猩等的同源性大于98%,与鼠的同源性为95%.羊驼aa2编码缬氨酸,而猪、人与牛等动物则编码异亮氨酸,均属于非极性氨基酸;羊驼aa201编码脯氨酸,是非极性氨基酸,而猪、人与牛等动物则编码丝氨酸,是不带电荷的极性氨基酸;羊驼aa144编码精氨酸,而猪、人与牛等动物则编码赖氨酸,均为带正电荷的极性氨基酸.蛋白质二级结构及功能分析结果显示:此二级结构中含有大量的α-螺旋;该蛋白编码肥大细胞/干细胞生长因子,属于酪氨酸激酶受体家族,其蛋白激酶活性位点位于248～260之间.本研究结果将为深入研究KIT基因与羊驼毛色遗传的关系奠定一定的理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	范瑞文	山西农业大学动物科技学院	100	437	10.0	16.0
2	董常生	山西农业大学动物科技学院	152	794	13.0	20.0
3	张巧灵	吉林大学农学部畜牧兽医学院	30	129	7.0	9.0
4	姜俊兵	山西农业大学动物科技学院	51	333	10.0	16.0