转录因子结合位点生物信息学研究进展

• 作者: 侯琳 朱云平 邓明华 钱敏平
• 来源期刊: 遗传
• 学科: 生物学
• 关键词: 转录因子结合位点 生物信息学 ChIP-chip 位置权重矩阵 系统发育足迹分析法
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 365-373
• 页数: 9页
• 分类号: Q1
• 字数: 7973字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2009.00365

摘要

转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程.确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录调控网络的关键问题.随着高通量实验技术的发展,结合ChIP-chip实验以及多个基因组的序列信息来预测TFBS已成为新的研究热点.本文简要概述了用于TFBS定位的实验技术,TFBS信息相关的数据库,重点评述了描述TFBS的模型以及预测TFBS的多种软件.TFBS的生物信息学研究的发展,将与相关领域相互促进,有助于进一步揭示转录调控机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱云平		3	115	3.0	3.0
2	侯琳	北京大学数学科学学院	34	210	8.0	13.0
4	钱敏平	北京大学数学科学学院	13	107	6.0	10.0
8	邓明华	北京大学数学科学学院	16	115	5.0	10.0