荔枝LcAsr基因的生物信息学分析与载体构建

• 作者: 徐碧玉 王家保 董凤英 金志强
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 荔枝 LcAsr基因 生物信息学分析 载体构建 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术应用及组织培养
• 页码范围: 677-682
• 页数: 6页
• 分类号: S667.1
• 字数: 3800字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2009.05.022

摘要

根据荔枝果皮cDNA微阵列信号分析结果,对荔枝cDNA文库的BA05-H4克隆测序.NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)ORF分析发现其含有1个完整的开放读码框.编码152个氨基酸残基的多肽,为一全长cDNA序列.Blastx比对分析表明该基因编码的蛋白与其它植物来源的ASR(abscisic acid,stress and ripening indueible)蛋白高度同源,该基因被命名为LcAsr,通过PCR的方法获得其DNA全长序列.生物信息学分析结果表明,LcAsr基因的DNA序列全长为1 177 bp,读码框中间包含1个488 bp的内含子.Protparam预测分析结果表明LcAsr基因编码蛋白的分子式为C756H1130N228O238S1,相对分子质量为17 252.7,等电点pI6.10,富含Glu、His、Lys、Ala.Predict protein预测该蛋白的二级结构主要是α螺旋.有1个酪氨酸激酶磷酸化位点、2个酪蛋白激酶II磷酸盐化位点、3个豆蔻酰化位点等,并具有很高的亲水性,预测该蛋白位于细胞核.构建了植物荧光表达载体pCAMBIA-LcAsr,并通过基因枪转化法转化洋葱表皮细胞进行瞬时表达,对LcASR蛋白进行亚细胞定位,结果表明LcASR蛋白定位于细胞核.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王家保	中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物技术重点实验室	79	691	14.0	22.0
2	金志强	中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物技术重点实验室	98	894	17.0	25.0
3	徐碧玉	中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物技术重点实验室	96	1042	20.0	28.0
4	董凤英	中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物技术重点实验室	6	42	4.0	6.0