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摘要:
运用生物信息学的方法对蜜蜂丙糖磷酸异构酶(AMTPI)基因及其编码蛋白序列进行了初步分析,得到了与基因和蛋白质组学研究相关的一些基本参数.结果表明,AMTPI基因序列由744个碱基组成,编码由247个氨基酸组成的蛋白质.AMTPI总的原子数目为 3 818,分子式为C1 207H1 920N328O359S4,分子量为 26 898.71,等电点pI=8.04,摩尔消光系数为 34 950,在哺乳动物体内的半衰期为30 h.疏水性分析结果表明AMTPI为亲水蛋白,不稳定参数为27.32,属较稳定蛋白,不含信号肽序列,跨膜结构不明显,亚细胞定位于细胞质.AMTPI具有多种二级结构形式,是典型的(α/β)8结构,在SWISS-MODEL服务器三维建模后,运用ViewerLite 5.0进行序列编辑,获得了AMTPI的三级结构模型.多重比对结果显示,多个物种丙糖磷酸异构酶(TPI)的整体相似度较高,有多个保守结构,可以作为分子进化研究的材料.用MEGA 4.0软件按Minimum evolution方案进行分子系统演化分析,获得了TPI氨基酸序列的分子进化树.
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文献信息
篇名 蜜蜂丙糖磷酸异构酶基因及其编码蛋白的生物信息学分析及分子进化研究
来源期刊 江苏农业学报 学科 生物学
关键词 蜜蜂 丙糖磷酸异构酶 生物信息学分析 分子进化
年,卷(期) 2009,(2) 所属期刊栏目 遗传育种·耕作栽培·生理生化
研究方向 页码范围 270-275
页数 6页 分类号 Q811.4
字数 3916字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1000-4440.2009.02.009
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 徐剑 苏州大学金螳螂建筑与城市环境学院 7 45 5.0 6.0
2 周君 苏州大学金螳螂建筑与城市环境学院 10 58 5.0 7.0
3 刘晓红 苏州大学金螳螂建筑与城市环境学院 9 19 3.0 4.0
4 陆小平 苏州大学金螳螂建筑与城市环境学院 1 1 1.0 1.0
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蜜蜂
丙糖磷酸异构酶
生物信息学分析
分子进化
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
江苏农业学报
双月刊
1000-4440
32-1213/S
大16开
南京市孝陵卫钟灵街50号省农科院内
28-113
1985
chi
出版文献量(篇)
3989
总下载数(次)
8
总被引数(次)
36498
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导