小麦和水稻auxin基因家族的生物信息学比较分析

• 作者: 史峥 孟成生 张俊红 张彩英 李爱丽 王笑颖 马峙英
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 小麦 水稻 植物生长素
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 页码范围: 15-19
• 页数: 5页
• 分类号: Q811
• 字数: 3491字
• 语种: 中文

摘要

根据测序获得的1条260 bp cDNA片段,通过预测发现其包含小麦植物生长素(AUXIN)基因的部分编码序列,通过电子延伸、设计引物,从小麦Mardler/7*百农3217的cDNA中扩增获得一条608 bp的cDNA片段,该基因序列数据库(GenBank)登录号为AY902381(基因)和(蛋白).编码202个氨基酸,预计蛋白的分子量为23.0 kDa,等电点为9.93.利用已经分离的小麦生长素(AUXIN)基因的保守序列为检索序列,对小麦和水稻中的AUXIN基因家族成员进行分析,利用这些基因编码蛋白序列构建系统发生树,查找在GenBank的EST数据库中查找这些基因的ESTs表达序列,分析了这些基因在细胞中的定位情况和蛋白结构的相似性,根据已知相似基因的功能,分析该基因有进一步深入研究的必要.