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两个小麦甲基结合蛋白基因cDNA全长克隆及其在种子中的表达特性
两个小麦甲基结合蛋白基因cDNA全长克隆及其在种子中的表达特性
作者:
凌娜
司志飞
孟凡荣
尹钧
张艳霞
李永春
王潇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甲基结合蛋白
基因克隆
表达特性
小麦种子
摘要:
[目的]分析小麦甲基结合蛋白基因TaMBD1和TaMBD6的序列特征及其在种子形成和萌发过程中的表达模式,为探讨小麦种子形成及萌发过程中的表观遗传学调控机制积累资料.[方法]利用RACE技术进行cDNA全长克隆,采用生物信息学软件分析克隆基因的编码蛋白特性,并通过半定量RT-PCR分析克隆基因在小麦种子不同发育阶段及萌发过程中的表达模式.[结果]获得了小麦甲基结合蛋白基因TaMBD1和TaMBD6的cDNA全长,可分别编码193和187个氨基酸.氨基酸序列分析发现,TaMBD1和TaMBD6均包含有典型的甲基结合域,TaMBD1还包含1个CW型的锌指结构域.三维结构分析显示,TaMBD1和TaMBD6均可形成由β-折叠、α-螺旋及C-端扭曲共同构成的特定夹层结构.表达特性分析表明:TaMBD1在种子发育过程中一直保持有较高水平的稳定表达,而在萌发过程中呈现出有规律的表达动态,印胚中的表达量逐渐增强,胚乳中的表达量却逐渐减弱;TaMBD6在种子发育过程中呈现出先升高后降低的表达趋势,以开花后15d时表达量最高,但在种子萌发过程中却未检测到其表达.[结论]首次克隆了小麦甲基结合蛋白基因TaMBD1和TaMBD6的cDNA全长,这2个基因的编码蛋白均包含有与DNA互作的典型功能域;通过对这2个基因在种子发育及萌发过程中的表达特性分析表明,TaMBD1在小麦种子的发育及萌发过程中均发挥重要调控功能,而TaMBD6仅与种子发育过程中的基因表达调控有关;研究结果为进一步探讨小麦种子形成和萌发过程的基因表达调控机制提供了重要信息.
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(/年)
文献信息
篇名
两个小麦甲基结合蛋白基因cDNA全长克隆及其在种子中的表达特性
来源期刊
中国农业科学
学科
农学
关键词
甲基结合蛋白
基因克隆
表达特性
小麦种子
年,卷(期)
2009,(12)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
研究方向
页码范围
4132-4138
页数
7页
分类号
S5
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2009.12.002
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
尹钧
河南农业大学生命科学学院
126
1822
23.0
37.0
2
李永春
河南农业大学国家小麦工程技术研究中心
33
209
9.0
13.0
3
孟凡荣
河南农业大学生命科学学院
24
139
8.0
11.0
4
司志飞
河南农业大学生命科学学院
7
66
3.0
7.0
5
凌娜
河南农业大学生命科学学院
4
4
2.0
2.0
6
王潇
河南农业大学国家小麦工程技术研究中心
4
5
2.0
2.0
7
张艳霞
河南农业大学生命科学学院
4
74
2.0
4.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(28)
共引文献
(44)
参考文献
(18)
节点文献
引证文献
(2)
同被引文献
(4)
二级引证文献
(0)
1947(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1961(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1985(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
1989(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
1990(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
1992(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
1993(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1995(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
1996(2)
参考文献(0)
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1997(4)
参考文献(0)
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1998(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
1999(5)
参考文献(1)
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参考文献(3)
二级参考文献(3)
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参考文献(1)
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2008(2)
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2009(2)
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2009(2)
参考文献(2)
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二级引证文献(0)
2012(2)
引证文献(2)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
甲基结合蛋白
基因克隆
表达特性
小麦种子
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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