麻鸭和樱桃谷鸭的CD3ε、CD4、CD8α基因ORF克隆及序列分析

• 作者: 张万坡 李卫 白家媛 程国富 胡薛英 许媛媛 谷长勤 陈敏
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: CD3ε CD4 CD8α 序列分析 同源性
• 年，卷（期）: 2009,（12）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 4428-4434
• 页数: 7页
• 分类号: S8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.12.039

摘要

[目的]分析比较中国部分品种鸭的CD3ε、CD4和CD8α基因ORF序列,为研究CD3ε链、CD4和CD8α链的结构和功能及其抗体的应用提供依据.[方法]利用RT-PCR,对麻鸭、樱桃谷鸭的CD3ε,CD4和CD8α基因ORF序列克隆测定,应用ClustaIX(1.83)和DNAstar生物学软件分别与GenBank上公布的北京鸭CD3ε(AF378704)、CD4(AF378701)和CD8 α(AF378373)基因ORF序列进行序列分析.[结果]麻鸭、樱桃谷鸭、北京鸭CD3ε和CD4基因ORF序列及所编码的氨基酸同源性为99%;北京鸭和麻鸭CD8α基因ORF序列同源性为99%,与樱桃谷鸭的同源性为95%.麻鸭和北京鸭CD8 α基因ORF序基因编码的氨基酸完全一致,与樱桃谷鸭的CD8 α存在16处位点差异,其中胞外区有15个氨基酸的差异,使亲水性、抗原性以及此区域位于蛋白质表面的可能性都有明显差异.从遗传发生树得出樱桃谷鸭、北京鸭,麻鸭CD3ε和CD4的ORF序列相互之间的遗传关系近;樱桃谷鸭、麻鸭和北京鸭CD8α基因ORF序列之间的遗传关系较远.[结论]樱桃谷鸭,北京鸭、麻鸭CD3 E和CD4的ORF序列遗传变异性低,樱桃谷鸭与麻鸭和北京鸭CD8α基因ORF之间具有较高遗传变异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	程国富	华中农业大学动物医学院	105	844	16.0	25.0
2	李卫	华中农业大学动物医学院	3	88	2.0	3.0
3	白家媛	华中农业大学动物医学院	4	102	3.0	4.0
4	谷长勤	华中农业大学动物医学院	74	501	12.0	19.0
5	张万坡	华中农业大学动物医学院	44	246	8.0	14.0
6	胡薛英	华中农业大学动物医学院	98	712	14.0	23.0
7	许媛媛	华中农业大学动物医学院	1	7	1.0	1.0
8	陈敏	华中农业大学动物医学院	7	22	3.0	4.0