正交设计优化稻瘟病菌SSR-PCR反应体系

• 作者: 张亚玲 张崎峰 王士磊 蔡鑫鑫 靳学慧
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 稻瘟病菌 SSR-PCR 体系优化
• 年，卷（期）: 2009,（22）
• 所属期刊栏目: 农业生物技术
• 页码范围: 10426-10428
• 页数: 3页
• 分类号: S188
• 字数: 2784字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2009.22.038

摘要

[目的] 筛选最佳的稻瘟菌SSR-PCR反应体系.[方法] 利用正交设计对稻瘟菌SSR-PCR反应体系中的5个因素(Taq DNA聚合酶、Mg2+、模板DNA、dNTP、引物)在4个水平上进行优化试验,筛选出各反应因素的最佳水平并进行退火温度梯度试验筛选最佳的退火温度.[结果] 稻瘟菌SSR-PCR反应的最佳体系为:反应总体积为20 μl,Taq DNA聚合酶1.0 U,Mg2+ 2.0 mmol/L,DNA 100 ng,dNTP 50 μmol/L,引物(ms355~356)0.4 μmol/L,最佳退火温度为58.5 ℃.在此体系下可从稻瘟菌材料基因组DNA中扩增出300 bp左右清晰的目的条带,说明该体系稳定,适用于稻瘟菌基因组DNA的SSR标记.[结论]该研究为稻瘟菌的分子标记、遗传多样性研究和分子育种奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	靳学慧		110	867	15.0	24.0
2	张亚玲		67	394	10.0	17.0
3	蔡鑫鑫		7	67	5.0	7.0
4	张崎峰		2	6	1.0	2.0
5	王士磊		3	41	3.0	3.0