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家蚕孤雌生殖相关蛋白PGL的鉴定与生物信息学分析
家蚕孤雌生殖相关蛋白PGL的鉴定与生物信息学分析
作者:
吕正兵
夏佳音
张文平
张耀洲
聂作明
龙晓辉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
家蚕孤雌生殖
差异表达蛋白
二维凝胶电泳
基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱
磷脂酰肌醇蛋白聚糖
基因克隆
生物信息学分析
摘要:
应用二维凝胶电泳(2DE)技术分离有性生殖蚕卵与孤雌生殖蚕卵的差异蛋白,通过基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱(MALDI-TOF-TOF MS)分析获得大量小肽的序列特征.与已构建的家蚕cDNA文库及蛋白质数据库进行比对,确定一个在家蚕孤雌生殖过程中表达量显著上调的差异蛋白为磷脂酰肌醇蛋白聚糖(phosphatidylinositol glyean,PGL).为了探讨PGL蛋白在家蚕孤雌生殖发生中的作用,采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术扩增目的基因5'端片段,获得PGL蛋白基因的全长cDNA,生物信息学分析显示该基因cDNA全长1 038 bp,编码345个氨基酸,其编码蛋白理论分子质量为39.516 kD,等电点为5.845,包含1个保守的GP18结构域,信号肽概率为0.997,可能为分泌型蛋白,预测蛋白功能域包含酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化、N糖基化、蛋白激酶c磷酸化等多个功能位点.依据PGL蛋白的理化性质、结构功能推测其有可能在不同程度上通过细胞信号转导途径参与了家蚕孤雌生殖发生过程并发挥重要作用.
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文献信息
篇名
家蚕孤雌生殖相关蛋白PGL的鉴定与生物信息学分析
来源期刊
蚕业科学
学科
农学
关键词
家蚕孤雌生殖
差异表达蛋白
二维凝胶电泳
基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱
磷脂酰肌醇蛋白聚糖
基因克隆
生物信息学分析
年,卷(期)
2010,(6)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
889-896
页数
分类号
S881.2|Q51
字数
5479字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.0257-4799.2010.06.002
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
张耀洲
浙江理工大学生命科学学院生物化学研究所
87
372
9.0
15.0
2
吕正兵
浙江理工大学生命科学学院生物化学研究所
46
82
6.0
7.0
3
张文平
浙江理工大学生命科学学院生物化学研究所
13
27
3.0
5.0
4
聂作明
浙江理工大学生命科学学院生物化学研究所
31
63
5.0
6.0
5
夏佳音
浙江理工大学生命科学学院生物化学研究所
2
40
1.0
2.0
6
龙晓辉
浙江理工大学生命科学学院生物化学研究所
2
7
1.0
2.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
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引文网络
引文网络
二级参考文献
(36)
共引文献
(111)
参考文献
(21)
节点文献
引证文献
(0)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
1900(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1967(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
1968(1)
参考文献(1)
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1974(1)
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1988(1)
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二级参考文献(1)
1989(1)
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参考文献(0)
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
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节点文献
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差异表达蛋白
二维凝胶电泳
基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱
磷脂酰肌醇蛋白聚糖
基因克隆
生物信息学分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
蚕业科学
主办单位:
中国蚕学会
中国农业科学院蚕业研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
0257-4799
CN:
32-1115/S
开本:
大16开
出版地:
江苏省镇江市中国农业科学院蚕业研究所
邮发代号:
28-23
创刊时间:
1963
语种:
chi
出版文献量(篇)
2881
总下载数(次)
12
总被引数(次)
23392
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
期刊文献
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