中国沿海鳓不同地理群体16S rRNA基因的遗传变异分析

• 作者: 吕振明 吴常文 张建设 樊甄姣 许逸天
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鳓 16S rRNA基因 遗传变异
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 463-470
• 分类号: S91
• 字数: 4906字
• 语种: 中文

摘要

为阐述过度捕捞后中国现存鳓(Ilisha elongata)资源的种质状况,采用16S rRNA基因测序技术对青岛、舟山、厦门和广州4个鳓地理群体的种群结构及遗传变异进行研究.通过对4个鳓群体共45个个体的线粒体16S rRNA基因进行测序,获得1个长度为657 bp的同源序列.45个个体中共检测到32个多态位点,多态位点比例达4.88%,其中插入或缺失位点10个;45个个体中检测出20个单倍型,单倍型多样性指数(H)达0.812,核苷酸多样性指数(Pi>)达0.0031,平均核苷酸差异数(K)达2.016.结果表明,中国现存鳓种群仍具较高的遗传多样性水平.对4个群体的遗传结构进行检测表明,青岛群体与其他3个群体间存在显著的遗传分化,两个类群间存在1个同定位点的核苷酸差异,分化系数(Fst)达0.3852(P<0.01),基因流(Nm)为0.7980;而舟山、厦门和广州这3群体内部则无显著遗传分化(P>0.01);AMOVA检测显示,69.48%的遗传差异存在于群体内部,而30.52%的遗传差异存在于群体间;聚类分析结果和单倍型网络关系图也证实上述鳓群体的地理分化.推测青岛群体的分化可能与晚更新世以来频繁的海平面变化有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴常文	浙江海洋学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室	149	1482	20.0	27.0
2	吕振明	浙江海洋学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室	24	301	12.0	16.0
3	许逸天	浙江海洋学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室	3	50	3.0	3.0
4	樊甄姣	浙江海洋学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室	11	134	8.0	11.0
5	张建设	浙江海洋学院浙江省海洋养殖装备与工程技术重点实验室	37	259	10.0	15.0