一种面向基因与疾病关系的文本挖掘方法

• 作者: 孙啸 袁志栋 谢建明 韦有兵 龚乐君
• 来源期刊: 东南大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 生物医学 文本挖掘 关系抽取 实体识别
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 页码范围: 486-490
• 分类号: TP391
• 字数: 4438字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-0505.2010.03.010

摘要

结合模式匹配、生物医学本体及共现技术,设计了一种自动抽取基因与疾病、基因与基因之间关系的文本挖掘方法,并开发了一个可以处理海量文本数据的系统.该系统可抽取与疾病相关的基因实体,挖掘基因与疾病、基因与基因之间的关系,衡量基因与疾病实体的相关性,并为分析基因与疾病、基因与基因之间的关系提供了网络可视化工具.实验结果表明,系统在测试数据集上抽取基因与疾病之间的关系可获得83.0%的综合测评率,抽取基因与基因之间的关系可获得78.5%的综合测评率.该系统已成功应用于乳腺癌及相关基因的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙啸	东南大学生物电子学国家重点实验室	71	488	12.0	20.0
2	谢建明	东南大学生物电子学国家重点实验室	50	187	7.0	10.0
3	龚乐君	东南大学生物电子学国家重点实验室	2	7	1.0	2.0
7	韦有兵	东南大学生物电子学国家重点实验室	1	7	1.0	1.0
8	袁志栋	东南大学生物电子学国家重点实验室	3	10	2.0	3.0