草菇Volvariella volvacea中乳清酸核苷-5'-单磷酸脱羧酶编码基因vv-pyrG的克隆和序列分析

• 作者: 牛丽英 谭琦 陈明杰 鲍大鹏
• 来源期刊: 上海农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草菇 巢式简并PCR vv-pyrG基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 页码范围: 33-37
• 页数: 5页
• 分类号: S646|Q78
• 字数: 3351字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3924.2010.01.009

摘要

运用简并PCR和基因组步行技术克隆常见食用菌草菇的乳清酸核苷-5'-单磷酸脱羧酶编码基因(vv-pyrG基因),并运用生物信息学和系统发育学的方法对所获得的基因进行了序列分析.结果显示:vv-pyrG基因的编码区长度为920 bp,含有2个长度分别为65 bp和54 bp的内含子,可以编码1个含有266个氨基酸残基的蛋白质序列.该氨基酸序列经比对分析,显示与裂褶菌(Schizophyllum commune)和灰盖鬼伞(Coprinus cinereus)的OMPDC序列的相同性分别为58%和64%,相似性分别为74%和78%.对24种真菌的OMPDC氨基酸序列进行系统发育分析表明,系统进化树中草菇与灰盖鬼伞、裂褶菌、双色蜡蘑(Laccaria bicolor)和白腐菌(Phanerochaete sordida)聚在一起,在节点上的支持率是97%.