高等植物F3′H cDNA及其氨基酸序列的生物信息学分析

• 作者: 李云 李会容 杨晓娜 苏丽 赵昶灵
• 来源期刊: 云南农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 高等植物 类黄酮3′-羟化酶基因 cDNA序列 氨基酸序列 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传·育种
• 页码范围: 316-326
• 分类号: Q946.5
• 字数: 5641字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-390X.2010.03.003

摘要

用生物信息学方法对GenBank中拟南芥、油菜、大豆、矮牵牛和高梁等的类黄酮3′-羟化酶基因的cDNA序列及其编码氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、功能域和进化关系进行了初步预测和分析.结果表明:不同植物类黄酮3′-羟化酶基因cDNA序列的相似性为69.5%,其起始密码子均为ATG,终止密码子均为TAA、TAG或TGA,包括5′,3′非翻译区和一个开放阅读框;不同植物类黄酮3′-羟化酶基因cDNA 序列编码的氨基酸序列的理化性质基本一致,相似性为72.5%,含有6段保守氨基酸序列,是"PPGR"、"AGTDT"、"RPPN"、"AYNY"、"IKALLL"、"TPLS";在进化关系上可划分为两大类;不同植物类黄酮3′-羟化酶具有一个跨膜结构域、定位于内质网上,并有一段与细胞色素P450功能区相匹配的功能域;类黄酮3′-羟化酶属具转运肽的亲水性稳定分泌蛋白,其二级结构为α-β型,α-螺旋和无规卷曲为最主要的结构元件,延伸链和β-转角散布于整个结构.可为类黄酮3′-羟化酶基因的克隆和遗传操作提供理论参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵昶灵	云南农业大学农学与生物技术学院	89	968	17.0	27.0
2	苏丽	云南农业大学农学与生物技术学院	4	151	4.0	4.0
3	杨晓娜	云南农业大学农学与生物技术学院	4	151	4.0	4.0
4	李会容	云南农业大学农学与生物技术学院	5	166	4.0	5.0
5	李云	云南农业大学农学与生物技术学院	10	219	7.0	10.0