微阵列比较基因组杂交技术检测不明原因智力低下/发育迟缓患儿的基因组拷贝数变异

• 作者: 丁秀原 吴柏林 张霆 王珺 王立文 郭金 陈晓丽
• 来源期刊: 中国循证儿科杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 智力低下 发育迟缓 微阵列比较基因组杂交技术 基因组拷贝数变异 微缺失/重复综合征
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 85-93
• 页数: 9页
• 分类号: R72
• 字数: 5224字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-5501.2010.02.002

摘要

目的 应用高分辨微阵列比较基因组杂交技术(Array-CGH),对中国人群不明原因的智力低下/发育迟缓(MR/DD)患儿进行全基因组拷贝数变异(CNVs)筛查,获得在这些不明原因MR/DD患儿中CNVs的检出率,并分析其中的罕见CNVs与MR/DD的相关性,以此评估Array-CGH对不明原因MR/DD可能的遗传病因诊断作用.方法 根据特定筛选条件收集在首都儿科研究所临床诊断为不明原因MR/DD患儿,用Oligo 244 K DNA芯片筛查全基因组CNVs.针对所发现的CNVs,首先将其与国际基因组CNVs多态性数据库(database of genomic variants)进行比对,剔除常见多态性CNVs,将获得的罕见CNVs应用美国波士顿儿童医院遗传诊断实验室的临床分子诊断平台,结合基因组异常拷贝数数据库(DECIPHER)进行核查并与既往相关文献比对,以发现罕见CNVs在不明原因MR/DD患儿中的检出率.结果 2004年7月至2008年7月共收集111例不明原因MR/DD患儿,平均年龄为6岁,男女比例为1.775.28例患儿发现36个罕见CNVs,CNVs平均长度为1 326 kb (29～8 760 kb),这些CNVs均无法被常规染色体G带检查所识别.通过评估,19例患儿携带可能与MR/DD相关的CNVs,另1例患儿的CNVs临床意义不明确,Array-CGH在不明原因MR/DD患儿中发现携带与疾病相关的罕见CNVs的诊断率为17.1%(19/111例).22/36个(66.1%)罕见CNVs曾被美国波士顿儿童医院Array-CGH数据库、DECIPHER数据库、既往MR/DD微阵列研究文献所报道.1例患儿在15q11.2-13.1存在2 098 kb的基因组缺失,覆盖Prader-Willi综合征/Angelman综合征关键区的多个候选基因,包括SNRPN、NECDIN、SnRNAs和UBE3A,结合该患儿面部表型、临床检查以及Array-CGH结果 ,诊断为非典型性Prader-Willi综合征.结论 基因组CNVs相关的微缺失/重复是中国人群中不明原因MR/DD患儿的原因之一,高分辨Array-CGH技术可在不明原因MR/DD患儿中发现更多的遗传病因,帮助和提高不明原因MR/DD的分子诊断水平.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王立文	首都儿科研究所附属儿童医院神经科	68	381	11.0	15.0
2	丁秀原	首都儿科研究所遗传室	18	187	6.0	13.0
3	张霆	首都儿科研究所分子免疫实验室	79	456	12.0	17.0
4	吴柏林	哈佛医学院附属儿童医院遗传诊断实验室	7	64	4.0	7.0
6	王珺	首都儿科研究所附属儿童医院神经科	27	136	7.0	10.0
7	陈晓丽	首都儿科研究所分子免疫实验室	15	69	5.0	7.0
8	郭金	首都儿科研究所分子免疫实验室	2	22	2.0	2.0