多聚半乳糖醛酸酶基因家族的分子进化

• 作者: 张弿 曹家树
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 多聚半乳糖醛酸酶 序列联配 分子进化
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 数据分析
• 页码范围: 174-180
• 页数: 7页
• 字数: 4749字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.01.026

摘要

多聚半乳糖醛酸酶(polygalacturonase,PG)广泛存在于细菌、真菌和植物中,目前数据库中已积累了大量的序列资料.为了进一步了解PG基因家族的分子进化,以及其作为系统进化研究材料的可能性,本研究选取了88条来自不同物种包括细菌、真菌和植物的PG蛋白序列,用CLUSTALW程序对其氨基酸序列进行了联配,并用邻位相接法构建了系统进化树.结果表明,尽管不同来源的PG序列表现了很大的差异,但仍有4个保守性极强的结构域存在(~(175)NTD、~(197)DD、~(218)GHG和~(250)RIK);同时发现在PG序列中大多数的Cys 位点均具有较好的保守性,而且在细菌、真菌和植物的PG序列中各有自身保守的Cys位点,Cys的保守性体现了物种的分类关系;进一步构建分子进化树显示,PG基因基本上首先根据物种类型而聚类,明显地划分为细菌、真菌和植物三大类;其次,不同作用方式的内切PG(endo-PG)和外切PG(exo-PG)在各类群中也都处于完全独立的分支中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹家树	浙江大学蔬菜研究所细胞与分子生物学实验室	144	2996	30.0	48.0
2	张弿	浙江大学蔬菜研究所细胞与分子生物学实验室	1	9	1.0	1.0